닥터모로의 dna 다운로드

. 분석된 데이터의 진위는 다음과 같은 여러 기준에 의해 확보되었다: (i) 전용 고대 DNA 시설의 사용; (ii) DNA 추출 전에 뼈 샘플의 활발한 오염 제거 프로토콜; (iii) 빈 추출물 및 PCR 음성 대조물의 포함; (iv) 다중 haplotype은 대부분의 추출 배치 내에서뿐만 아니라 전체적으로 연구 내에서 수득되었다; (v) 두 개의 가장 일반적인 고대 haplotype (aHap1 및 aHap2)는 다른 추출 및 증폭 프로토콜 및 상이한 물질 유형 (뼈 및 coprolites)을 사용하여 두 개의 별도 실험실에서 수득되었다; 및 (vi) 모든 시퀀스는 뼈, 코프롬라이트 및 스킨이 M. 갈로파보임을 나타낸다. 21개의 뼈에 대해 반복 추출을 실시하였고, 독특하고 특이한 haplotype을 가진 모든 샘플을 포함하여 추가로 27개의 샘플을 위해 반복 증폭을 수행하였다. 3개의 코프롬산 시료 및 8개의 M. g. 갈로파보 시편에 대해 반복 추출을 수행하였다. 모든 복제에 대해 일관된 결과를 얻었습니다. 완전한 미토콘드리아 시토크롬-b 유전자(1,143 bp)를 12taxa에 대해 서열화하였다; 212자 계통유전학적으로 유익했다. 평균 뉴클레오티드 주파수는 다음과 같다: 아데닌, 27.2%; 시토신, 28.9%; 구아닌, 12.8%; 31.1%를 기록했다. 유익한 뉴클레오티드 치환의 비교는 전이가 전환율보다는 6 배 더 일반적이었다는 것을 밝혔습니다.

그룹 내 taxa에 대해 계산된 뉴클레오티드 위치당 유익한 치환은 13개의 치환, 2번째 위치에서 2개, 3번째에서 125개에서 발생했습니다. 100,000개의 무작위로 생성된 나무에 대해 계산된 G1 통계(G1 = -0.8032)는 데이터 내에서 강한 계통발생 신호를 나타냈다(Hillis 1991; 힐리스와 훌센벡 1992; 훌슨벡 1991). PCR 및 DNA 시퀀싱 프로토콜에 사용되는 프라이머의 서열. 역입프라이머는 “R”로 식별되며 상호 보완적인 방향으로 식별됩니다. 각 프라이머의 근사 위치는 시토크롬-b 서열에서 제1 뉴클레오티드로부터 계산된 뉴클레오티드의 위치에 기초한다. 우리의 연구에서 수행 된 프라이머 서열에서 퇴화되는 별도의 뉴클레오티드 (/) 분리 된 뉴클레오티드는 현재 S. hispidus로 인식되는 것 내에서 최소 3 종의 존재에 대한 강력한 증거를 제공합니다. 사실, 이 그룹을 단필 단위로 처리하여 taxa를 단일 클래데로 제한하면 더 많은 수의 단계, 낮은 일관성 지수 및 더 높은 최대 가능성 점수를 보유한 나무가 생겨나게 되었습니다. 이 가설은 다른 연구에서 제공하는 S. hispidus의 아종 중 문서화 된 가변성과 일치합니다 (카메론과 맥클레어 1988; 달비와 릴레빅 1969; 디커맨 1992; 풀러 외. 1984), 그룹과 clades의 회원은 연구 간에 다르지만.

국내 조류와 현지 야생 칠면조 사이의 제한된 양의 내향성은 현재 메리암의 인구 (매우 낮은 빈도임)에서 우세한 고대 국내 haplotype (aHap1)의 존재에 의해 지원됩니다 (15). 이 유전자 흐름은 현지 야생 인구에 통합되는 탈출 국내 암탉의 결과 가능성이 있었다.

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